Die Hauptidee von Thonmi ist es, Zusammenarbeit und Austausch zu ermöglichen und nicht in Wettbewerb zu anderen Institutionen zu treten. Deshalb arbeiten wir eng mit Projekten und Veranstaltungen zusammen, die mit ähnlichen Inhalten in der Tschechischen Republik und in Europa organisiert werden. Unsere Partner sind zum Beispiel das Orientinstitut der Akademie der Wissenschaften der Tschechischen Republik, Potala und das Schrödinger-Institut in Rumburk.
